บารอนอาชูระ ผู้มีสองร่างในหนึ่งเดียว เปี่ยมด้วยความฉลาดและอำมหิต เคานต์บร็อกเคน นักรบเยอรมันหัวขาดผู้ยังมีชีวิตด้วยพลังวิทยาศาสตร์ต้องห้าม ไวเคานต์พิกแมน อสูรร่างยักษ์ผู้ภักดีต่อคำสั่งของเฮลล์อย่างไม่ลังเล เมื่อกองทัพสัตว์จักรกลบุกโจมตีสถาบันพลังงานโฟตอนอย่างฉับพลัน ท่ามกลางเปลวเพลิงและซากปรักหักพัง ชะตากรรมของโลกจึงตกอยู่ในมือของเด็กหนุ่มคนหนึ่ง คาบูโตะ โคจิ หลานชายของศาสตราจารย์จูโซ ก่อนสิ้นใจ ศาสตราจารย์ได้มอบมรดกสุดท้ายให้แก่โคจิ หุ่นยนต์ยักษ์ที่สร้างขึ้นจากโลหะพิเศษ “ซูเปอร์อัลลอย Z” และขับเคลื่อนด้วยพลังงานโฟตอน หุ่นยนต์นั้นมีนามว่า “มาซิงเกอร์ Z” อาวุธที่สามารถเป็นได้ทั้งเทพเจ้าผู้พิทักษ์ หรือปีศาจผู้ทำลายล้าง ขึ้นอยู่กับหัวใจของผู้ควบคุม

โคจิ เด็กหนุ่มเลือดร้อนผู้เต็มไปด้วยความโกรธแค้นต่อการสูญเสีย ต้องเรียนรู้ที่จะควบคุมพลังอันมหาศาลนี้ ไม่เพียงเพื่อแก้แค้น แต่เพื่อปกป้องผู้คนที่เขารัก ระหว่างการต่อสู้อันดุเดือด ความลับของอารยธรรมไมซีเนียน เกาะบาร์ดอส และต้นกำเนิดที่แท้จริงของมาซิงเกอร์ Z ค่อย ๆ ถูกเปิดเผย เผยให้เห็นว่าศึกครั้งนี้มิใช่เพียงการแย่งชิงพลังงาน หากแต่เป็นการต่อสู้ที่ผูกพันกับอดีตกาลอันยาวนานนับพันปียิ่งโคจิเข้าใกล้ความจริงมากเท่าไร เขายิ่งตระหนักว่าเส้นแบ่งระหว่าง “ผู้กอบกู้” กับ “ผู้ทำลาย” นั้นบางเพียงใด พลังที่เขาถือครองอาจช่วยโลกให้รอดพ้นจากความมืด หรืออาจเป็นชนวนให้มนุษยชาติเผชิญหายนะครั้งใหญ่ที่สุดนี่คือเรื่องราวของสงครามระหว่างวิทยาศาสตร์และอำนาจโบราณ ระหว่างความหวังและความสิ้นหวัง และการเติบโตของเด็กหนุ่มผู้ต้องเลือกเส้นทางของตนเอง ท่ามกลางเสียงคำรามของเครื่องจักรและเปลวไฟแห่งโชคชะตา