หลังจากแยกย้ายฝึกฝนตัวเองนานถึง 2 ปี กลุ่มโจรสลัดหมวกฟางก็กลับมารวมตัวกันอีกครั้ง พร้อมออกเดินทางสู่โลกใต้ทะเลที่เต็มไปด้วยความลึกลับใน เกาะมนุษย์เงือก (Fish-Man Island) จุดหมายสำคัญที่อยู่ระหว่างเส้นทางสู่โลกใหม่ การผจญภัยครั้งนี้ไม่ใช่แค่การเผชิญหน้ากับศัตรูที่แข็งแกร่งกว่าเดิม แต่ยังพาพวกเขาไปพบกับความขัดแย้งระหว่างมนุษย์และมนุษย์เงือกที่ฝังรากลึกมานาน

ลูฟี่และพรรคพวกต้องเผชิญหน้ากับโฮดี้ โจนส์ ผู้มีความเกลียดชังต่อมนุษย์อย่างรุนแรง จนกลายเป็นภัยคุกคามต่อความสงบสุขของทั้งเกาะ ขณะเดียวกัน เจ้าหญิงชิราโฮชิและจินเบก็เข้ามามีบทบาทสำคัญในการเปิดเผยความจริงเบื้องหลังความขัดแย้งที่หลายคนไม่เคยล่วงรู้

เมื่อเรื่องราวดำเนินไป ความลับในอดีตของเกาะมนุษย์เงือกก็เริ่มถูกเปิดเผย ทั้งเรื่องราวของราชินีโอโตฮิเมะ ฟิชเชอร์ ไทเกอร์ และบาดแผลจากการเหยียดหยามที่ส่งต่อความเกลียดชังจากคนรุ่นหนึ่งไปสู่อีกรุ่นหนึ่ง การต่อสู้ของลูฟี่จึงมีความหมายมากกว่าการเอาชนะศัตรู เพราะสิ่งที่เดิมพันอยู่คืออนาคตของผู้คนทั้งเกาะ