เมื่อสายลับมือหนึ่งต้องปลอมตัวเป็นคุณพ่อ จัดตั้งครอบครัวที่ไม่ธรรมดาเพื่อทำภารกิจลับระดับชาติ ชีวิตที่เคยเต็มไปด้วยอันตรายและการวางแผนอย่างรอบคอบก็กลับกลายเป็นความวุ่นวายที่เขาควบคุมไม่ได้! Spy x Family สปาย x แฟมิลี เป็นอนิเมะญี่ปุ่นแนวแอ็กชัน คอมเมดี้ และชีวิตครอบครัว ที่ผสมผสานเรื่องราวการจารกรรมเข้ากับความอบอุ่นของคนในบ้านได้อย่างลงตัว จุดเด่นของเรื่องไม่ได้มีเพียงภารกิจลับที่ต้องใช้ไหวพริบเพื่อเอาตัวรอด แต่ยังอยู่ที่ความสัมพันธ์ของคนสามคนที่ต่างมีความลับเป็นของตัวเอง ทว่ากลับต้องมาใช้ชีวิตร่วมกันในฐานะครอบครัวเดียวกันโดยไม่มีใครรู้ความจริงทั้งหมดของอีกฝ่าย

เรื่องราวเริ่มต้นขึ้นในโลกที่สองประเทศอย่างเวสทาลิสและออสทาเนียกำลังตกอยู่ในสถานการณ์ตึงเครียด แม้สงครามครั้งใหญ่จะผ่านพ้นไปแล้ว แต่ความขัดแย้งระหว่างทั้งสองฝ่ายยังคงมีโอกาสปะทุขึ้นได้ทุกเมื่อ หน่วยข่าวกรองเวสทาลิสจึงมอบภารกิจสำคัญให้กับสายลับระดับแนวหน้าที่มีรหัสประจำตัวว่า สนธยา (Twilight) เขาต้องแฝงตัวเข้าไปในออสทาเนียเพื่อสืบหาข้อมูลจากโดโนแวน เดสมอนด์ นักการเมืองผู้ทรงอิทธิพลและเป็นบุคคลสำคัญที่อาจเกี่ยวข้องกับแผนการคุกคามสันติภาพ ภารกิจครั้งนี้มีชื่อว่า Operation Strix และจำเป็นต้องอาศัยการเข้าถึงแวดวงสังคมชั้นสูง ซึ่งโรงเรียนอีเดนเป็นหนึ่งในสถานที่สำคัญที่เขาต้องเข้าไปเกี่ยวข้อง

ปัญหาคือการเข้าถึงบุคคลเป้าหมายไม่ใช่เรื่องง่าย เพราะสนธยาจำเป็นต้องสร้างภาพลักษณ์ของครอบครัวที่สมบูรณ์แบบขึ้นมา เพื่อให้ลูกของเขาสามารถเข้าเรียนในโรงเรียนอีเดนและมีโอกาสเข้าร่วมกิจกรรมที่เปิดทางให้พบกับครอบครัวเดสมอนด์ได้ เขาจึงต้องรับบทเป็นพ่อผู้แสนธรรมดา สร้างประวัติใหม่ จัดหาภรรยา และรับเลี้ยงเด็กสักคนให้ทันเวลา ทั้งหมดนี้เป็นเพียงส่วนหนึ่งของแผนการที่ต้องดำเนินไปอย่างรอบคอบ เพราะความผิดพลาดเพียงเล็กน้อยอาจทำให้ภารกิจที่สำคัญต่อความมั่นคงของประเทศต้องล้มเหลว